《忍者校园》是一部超现实的网络剧，描述的是拥有林林总总特殊忍术能力的学生在忍者校园里面发生的故事。为了使拥有"丹魂气"特殊力量的人类不迷途知返，所以在世界上存在着一个名为"忍者校园"的特殊教育机构。

它旨在通过规范化的忍术教学以及特殊训练将学生打造为寻求正义、维护和平的忍者，同时也激励学生寻求自己心中的忍道。在10集的篇幅中，不仅有嬉笑闹骂搞怪的校园生活，还会有紧张刺激的与外部邪恶势力抗争。而忍者校园的学生们也在着重重磨难中，从插科打诨的青少年而真正蜕变成为保护学校、朋友而战的合格忍者。